臭氧是一種單一來源的有機消毒劑，可殺死各種細菌、真菌和霉菌，如酵母，孢子和囊腫（臭氧殺死的生物）。臭氧與適當的協議一起使用，可在許多食品和飲料應用中提供有效的衛生設保障施，包括：

    在容器（即瓶子和瓶蓋，桶，桶，罐等）的消毒過程中使用含臭氧的水是臭氧的常見應用。臭氧與適當的協議和CT值一起使用可為容器和罐（即玻璃，塑料，聚合物，木材，不銹鋼等）提供有效和快速的殺菌消毒。另外，當在再循環模式中使用時，臭氧可在消毒過程中節省數升的水，并將臭氧分解為氧氣不會導致容器或罐體損壞。消毒后也不需要沖洗，這樣可以減少時間和用水量。 

 

節約水和能源以及維持灌裝線無菌是飲料行業是主要關注點。臭氧獨特的“冷滅菌”能力，無污染特性和低水分使用，使其成為化學品，蒸汽和熱水的絕佳替代品。由熱量產生的灌裝線組件的膨脹和收縮導致長期壓力會對灌裝線有一定的損壞，臭氧水的使用消除了這些壓力，從而減少了裝瓶生產線的停機時間和維護成本。 

 

消毒加工和轉移設備（即切割刀片，分揀臺和箱，管道，泵等）是食品和飲料行業的主要關注點。臭氧水溶液可用于快速消毒所有食品加工和轉移的設備，以消除設施內不需要的微生物的移動。 

 

用臭氧水消毒地板，墻壁，排水溝和其他表面可減少微生物（真菌，酵母和細菌），維護衛生設施，并消除氣味。 

 

使用氣態臭氧來控制霉菌，空氣傳播的生物和氣味是食品和飲料設施中的常見做法。氣態臭氧也被證明可以控制一些昆蟲（即果蠅），這些昆蟲不僅是一種麻煩，而且也是設施周圍微生物運動的主要載體。